Boruto doit assurer la protection de Tentô, mais il a du mal à supporter son attitude d'enfant gâté. Pourtant, les deux jeunes se rapprochent. Lorsque Tentô se fait kidnapper, Boruto part seul à sa recherche.

La guerre n'est plus qu'un souvenir et la paix s'est installée durablement. Mais un ennemi qui ressemble étrangement à Kaguya apparaît et s'attaque à Killer Bee. Sasuke enquête en secret et rentre pour prévenir Naruto du danger. A Konoha, les étudiants préparent l'examen des ninjas pour passer ninja de moyenne classe. Boruto, le fils de Naruto, doit y participer avec Sarada et Mitsuki.

Le coup d'envoi du tournoi du plus fort, qui décidera du sort des univers, a été lancé. L'équipe de l'univers 7, celle de Goku, est enfin au grand complet grâce au recrutement de dernière minute d'un ancien ennemi : Freezer est désormais de la partie !! Goku et ses coéquipiers se lancent donc dans une grande battle royale. Mais très vite, Freezer se rapproche de Frost, son alter-ego de l'univers 6. Que vont-ils comploter tous les deux ?!

Le “tournoi du plus fort” organisé par Zen-O est sur le point de commencer !! À la fin du match de présentation disputé par les dieux de la destruction, les règles de la compétition sont déterminées : l'univers gagnant sera épargné tandis que tous les autres seront annihilés. Pour participer, Goku va devoir sélectionner les dix meilleurs guerriers de l'univers 7 (hormis les dieux) et constituer une équipe de choc !

Tous les plus grands combattants des douze univers se sont réunis pour disputer le tournoi du plus fort. Mais lorsque Kale, une saiyanne de l'univers 6, se met à perdre la tête, elle élimine les autres participants les uns après les autres. L'équipe de Goku, celle de l'univers 7, ne compte plus que six guerriers. Vont-ils décrocher la victoire pour assurer la survie de leur univers ?!

L'univers 7 (celui de Goku) et l'univers 11 (celui de Jiren) sont les deux derniers concurrents du tournoi du plus fort. Face à Jiren et sa puissance écrasante, Goku active enfin le réflexe transcendantal, mais cela suffira-t-il à lui tenir tête ?! De retour sur Terre, d'autres ennuis attendent nos héros : cette fois, c'est Majin Boo qui est en danger !

Boruto rencontre Kawaki, un garçon qui porte le même sceau, Kâma, que le sien. Mais Kara, le groupe de personnes à la poursuite de Kawaki, le retrouve. Lors de l'affrontement, Kawaki semble en mauvaise posture...

Kawaki commence à s'habituer à la vie du village de Konoha. Boruto a un mauvais pressentiment... Au même moment, le kâma de Kawaki se transforme, et Jigen en sort !! L'affrontement entre Naruto et Jigen commence...

Kawaki est prisonnier des traumatismes du passé liés à son Kâma. Cependant, petit à petit, en vivant chez Boruto, son coeur commence à s'ouvrir. C'est alors que le noyau dur de Kara, qui poursuit Kawaki, s'introduit dans le village caché de Konoha ! De nouveau, de redoutables ennemis sont prêts à attaquer! !

Moro, un dangereux criminel capturé il y a dix millions d'années, s'est évadé de la prison galactique. Convoitant les Dragon Balls pour récupérer la totalité de ses pouvoirs, il se dirige vers la nouvelle planète Namek. Goku et Vegeta se rendent sur place pour le contrer, mais voilà que Moro absorbe leur énergie !