La guerre n'est plus qu'un souvenir et la paix s'est installée durablement. Mais un ennemi qui ressemble étrangement à Kaguya apparaît et s'attaque à Killer Bee. Sasuke enquête en secret et rentre pour prévenir Naruto du danger. A Konoha, les étudiants préparent l'examen des ninjas pour passer ninja de moyenne classe. Boruto, le fils de Naruto, doit y participer avec Sarada et Mitsuki.