En raison d'une épidémie de grippe canine, le maire de Megasaki ordonne la mise en quarantaine de tous les chiens de la ville envoyés sur une île qui devient alors l'Ile aux Chiens. Le jeune Atari, douze ans, vole un avion et se rend sur l'île pour rechercher son fidèle compagnon, Spots. Aidé par une bande de cinq chiens intrépides et attachants, il découvre une conspiration qui menace la ville.

Deux membres d'équipage doivent, suite à la destruction de leur plateforme minière, sauver leur équipe 11 km sous la surface de l'océan. À huit mille kilomètres des côtes, leur seule chance de survie est de rejoindre un vaisseau abandonné à pieds. Mais leur périlleux voyage s'avère encore plus dangereux lorsqu'une nouvelle menace surgit des confins de l'océan...